Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ccdc18Q640L5 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ccdc18Q640L5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Ccdc18Q640L5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Ccdc18Q640L5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc18Q640L5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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