Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms