Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itga6Q61739 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms