Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde3bQ61409 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde3bQ61409 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms