Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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PcolceQ61398 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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PcolceQ61398 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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PcolceQ61398 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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PcolceQ61398 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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