Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms