Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms