Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ctf1Q60753 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms