Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r196Q5SVD5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms