Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim58Q5NCC9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim58Q5NCC9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim58Q5NCC9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim58Q5NCC9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim58Q5NCC9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms