Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrrc47Q505F5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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