Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trp53i11Q4QQM4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms