Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Prdm6-202ENSMUST00000115398 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc43Q3V0L5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms