Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ankrd53Q3V0J4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms