Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ttc9Q3V038 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ttc9Q3V038 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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