Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capn13Q3UW68 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms