Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms