Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc9Q3U0M1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms