Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21440Q3TTD8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21440Q3TTD8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms