Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms