Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms