Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sppl2bQ3TD49 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms