Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Zbtb38Q3LR78 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbtb38Q3LR78 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms