Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrna5Q2MKA5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms