Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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