Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptcd3Q14C51 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms