Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Traf3ip1Q149C2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Traf3ip1Q149C2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Traf3ip1Q149C2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Traf3ip1Q149C2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Traf3ip1Q149C2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Traf3ip1Q149C2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Traf3ip1Q149C2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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