Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc162pQ0VG85 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms