Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc39dQ0VF76 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms