Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp2b3Q0VF55 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms