Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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