Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tff1Q08423 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms