Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MestQ07646 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MestQ07646 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MestQ07646 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms