Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Siah2Q06986 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms