Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah1bQ06985 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms