Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Arhgef38-204ENSMUST00000161932 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm16958-202ENSMUST00000181792 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sox12Q04890 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sox12Q04890 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms