Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms