Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms