Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.8 ms