Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pde1bQ01065 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Pde1bQ01065 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Pde1bQ01065 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Pde1bQ01065 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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