Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.7 ms