Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prop1P97458 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prop1P97458 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms