Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx3P81067 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms