Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Otx1P80205 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms