Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms