Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SeboxP70368 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeboxP70368 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms