Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms