Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sumo1P63166 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms