Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lsm5P62322 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms