Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pcbp1P60335 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms